砂眼衣原體（Chlamydia trachomatis）、解脲支原體（Ureaplasma urealyticum）和生殖道支原體（Mycoplasma genitalium）等就像淋病雙球菌一樣，都是引起男性尿道炎的細菌。 這些細菌當中以衣原體最多， 引起女性宮頸炎的細菌幾乎都是衣原體。 在男女的性傳染病中，衣原體是最常見的病原體之一。
衣原體跟淋病雙球菌一樣，在男性身上會引起尿道炎，在女性身上會引起宮頸炎，經由肛交可能會造成直腸炎，經由口交可能會造成咽頭炎。 如眼睛感染到衣原體，可能會造成結膜炎。
男性尿道炎會出現排尿疼痛、尿液混濁或尿意頻繁等症狀。 如病狀發展到精巢上體炎（睪丸炎），陰囊會開始腫痛。 女性的衣原體子宮頸炎幾乎無症狀，即使出現症狀也非常輕微，但病狀若持續發展，會在骨盤或腹腔內側引起腹膜炎，卵巢和輸卵管的部位也會發炎，進而使下腹部出現劇烈疼痛，有時甚至會造成不孕症或子宮外孕。 咽喉部位的感染則幾乎不會出現症狀。
若孕婦經由產道將衣原體傳染給嬰兒，嬰兒可能會罹患結膜炎或肺炎。

衣原體的傳染途徑及預防方法

衣原體存在於精液、陰道分泌液和咽頭粘膜等處，接觸到對方粘膜就會傳染。 由於感染後大多沒有症狀或症狀輕微，感染者可能會在不知情的情況下將衣原體傳染給對方。
欲防止衣原體傳染，使用保險套非常重要。
如孕婦感染衣原體，分娩時可能會使胎兒眼睛受到衣原體感染，導致嬰兒罹患結膜炎或肺炎。 為防止嬰兒受到感染，確實接受孕婦健康檢查也相當重要。

衣原體的檢查

衣原體以PCR方式（檢測衣原體特有的遺傳物質）進行檢查，採樣使用尿液或子宮頸、陰莖、咽喉、直腸的拭液或分泌物等等。
女性宮頸炎不僅症狀不易察覺，對女性也會造成長期影響， 如果查覺到有感染風險時，及早接受檢查和治療很重要。

衣原體的治療

確定感染衣原體後，須按醫師處方服用抗菌藥， 性行為對象最好也能及早就醫接受檢查治療。
衣原體引起的症狀與淋病類似，如疑似同時感染淋病雙球菌和衣原體，有時會一起進行治療。
開始接受衣原體的治療之後，一星期內勿與他人進行性行為，以免將衣原體傳染給對方。 由於衣原體很可能再度感染，治癒一段時間後有時仍需再度檢查。